在白酒分析中如果气相色谱仪出现假峰或者是峰丢失的故障，那么无疑会影响较终实验数据的准确性以及仪器本身的灵敏度，严重的甚至会失去分析的意义。因此，了解造成故障的原因以及根本上的解决方法尤为重要。
首先，谱析色谱工程师认为，造成峰丢失的原因可能有两种，一种可能是气路中存在污染问题，另一种则可能是峰没有完全分离开。针对靠前种情况，解决方法可以通过多次空运行和清洗气路(进样口、检测器等)来解决。其中，为了减少对白酒气相色谱仪气路的污染，可采取以下措施：
1.减少高沸点油类物质的使用；
2.注入进样口的样品应保持清洁；
3.使用尽量高的进样口温度、柱温和检测器温度；
4.程序升温的较后阶段应有一个高温清洗的过程。
白酒分析气相色谱仪峰丢失的第二种情况可能是峰没有分离开。当然，如果出现峰丢失这一故障，除了以上原因外，也有可能是因系统污染造成的柱效下降造成，或者是由于柱子老化导致的，但值得注意的是柱子老化所造成的峰丢失是渐进的、缓慢的，不是突然间发生的。
一般在白酒气相色谱仪分析中出现假峰的现象较少，如果出现假峰则一般是由于系统污染和漏气造成的，其解决方法也是通过检查气相色谱仪漏气和去除污染来解决。
对于色谱工作者来说，谱析仪器建议在平时的工作中，对于白酒气相色谱仪各部分的工作情况应当实时记录，以便在维护和保养时作为参考依据，同时注意GC运行环境，避免人为造成污染对仪器的影响。
