白酒分析气相色谱仪填充柱柱效比毛细管柱低，因此需要针对不同的样品配备许多不同的填充柱。如果使用毛细管柱，三支毛细管柱可分析 90% 以上的 GC 样品，四支毛细管柱可分析几乎所有 GC 样品。气相色谱仪厂家山东谱析总结出毛细管柱主要有以下优点。
一、分离效率高
一般毛细管柱的比渗透率约为填充柱的 100 倍，在同样的柱压下，可使用更长的毛细管柱，而载气流速可保持不变。
二、分析速度快
用毛细管色谱分析比用填充柱色谱速度,相比率（Vm/Vs）大，分配快， 有利于提高柱效；加上保留因子k小，渗透性好，因而分析速度快； 有利于提高柱效；加上保留因子k小，渗透性好，因而分析速度快；
三、总柱效高：
从单位柱长的柱效看，毛细管柱和填充柱处于同一数量级，但毛细管柱的长度比填充柱长，因此其总柱效远高于填充柱，大大提高分离复杂混合物的能力。总之，毛细管柱渗透性大，可采用长柱子和高载气流速，使其保持高柱效和快速分离。
四、柱容量小：
毛细管柱允许的进样量小，对进样和检测技术要求更高，需要采用分流进样和尾吹气路。另外白酒分析气相色谱仪使用毛细管柱灵敏度高，色谱峰窄、峰形对称。较多采用氢焰检测器程序升温方式。
