色谱仪器运行时，由于条件的变化或扰动，而引起的信号线的位置发生变化，称为基线漂移！气相色谱仪在使用程序升温时常常会出现基线漂移的现象，这种现象通常有以下几个原因：色谱柱流失、进样垫流失、进样器污染或检测器污染、气体流速的变化。如果使用高灵敏度检测器，即便是微弱的柱流失或系统污染都可能带来显著的基线漂移现象。为了提高定性和定量分析的可靠性，应尽可能的降低或消除基线漂移。
那么如何判断基线漂移问题的来源呢？方法如下：
首先把色谱柱从气相色谱仪上取下，堵住检测器的入口，再观察在程序升温时基线的漂移情况。如果基线不稳，那么污染来自检测器（解决办法请参考“如何降低检测器的污染”） ；如果基线是稳定的，证明检测器良好，此时用一小段熔融石英管把进样器和检测器连接起来，走一个升温程序，观察基线漂移情况，此时反映的是进样器的污染情况，如果基线不稳，可以确定问题来自进样口（解决办法请参考“如何降低进样器的污染” ）；如果基线稳定，证明检测器和进样口均未被污染，此时把柱子重新装上，走同样的升温程序，来确定是不是柱子流失带来的基线漂移。
