气相色谱仪分析时，可能会出现各种故障现象，影响实验结果。了解以下十一个气相色谱仪操作维护的注意事项，能很好地帮助操作人员解决各种故障现象。
1.按仪器说明书的规程操作
验收仪器时，不仅要清点所有零部件是否齐全，还要检查仪器说明书是否齐备，并妥善保存这些资料。在独立操作仪器之前，一定要认真阅读有关说明书，并严格按规程操作。这是做好分析的前提条件，而且一旦仪器出了问题，也好与厂商交涉，特别在保修期。
2.准备一份色谱柱测试标样
色谱柱的性能是保证分析结果的关键。新买的色谱柱，首先要用测试样品评价其性能。如果用色谱柱厂商提供的测试条件测试而结果不合格时，就可要求退货或换货。更重要的是此后的使用过程中色谱柱性能会变化，当分析结果有问题时，可以用测试标样测试色谱柱，并将结果与前一次测试结果相比较，这有助与确定问题是否出在色谱柱，以便于采取相应的措施排除故障。每次测试结果都应保存起来作为色谱柱寿命的记录。另外用过一段时间后，应对色谱柱进行一次高温老化，以除去柱内可能有的污染物，然后用测试标样评价色谱柱。
3.及时更换毛细柱密封垫
石墨密封垫漏气是气相色谱仪常见的故障之一。一定不要在不同的色谱柱上重复使用同一密封垫，即使是同一柱上卸下重新安装时，也要换新密封垫，这样能保证更高的工作效率。如果装上色谱柱后发现漏气而再更换密封垫，就要花费更长的时间。即使旧垫仍能使用，也要比原来多拧紧一些，弄得不好会拧断色谱柱。
4.使用纯度合乎要求的气体
载气一定要用高纯级的，以避免干扰分析和污染色谱柱或检测器。要知道一根色谱柱的价格是一瓶氮气或氢气价格的20倍以上。如果因为要省钱而用普通气体作载气，可能是丢了西瓜捡芝麻。检测器用辅助气也用高纯级的。虽然在灵敏度要求不高时，可使用普通气体，但其代价可能是检测器被污染。
5.定期更换气体净化气填料
变色硅胶可根据颜色变化来判断其性能，但分子筛等吸附有机物的净化器就不好用肉眼判断了。所以须定期更换，3个月更换一次。如果硅胶与分子筛装在一起，则更换硅胶时也要更换分子筛。
6.使用性能可靠的压力调节阀
仪器上装什么阀也许我们不能控制，但装在钢瓶上的减压阀一定要保证质量。有一些质量不好的新阀也会漏气，所以，经常检漏，随时发现问题是一个好的习惯。如果不注意这个问题，轻则造成气体浪费，重则出现安全问题，到时就悔之晚矣。
7.定期更换进样口隔垫
进样口隔垫漏气是另一个气相色谱仪常见故障。仪器要有自动检漏功能当然好一些，但也不能保证发现微小的漏气，更别说没有自动检漏功能的仪器了。另外隔垫的老化降解也会给气相色谱仪分析带来干扰。比如其碎屑掉进汽化室就可能导致鬼峰。
8.及时清洗注射器
干净的注射器能避免样品的记忆效应的干扰。更换样品时要清洗，用同一样品多次进样时也要用样品本身清洗注射器。一支注射器暂时不用时，更要彻底清洗，否则残留在其中的样品可能将针芯粘牢，造成注射器报废。使用自动进样器的用户也应注意此问题，经常更换和清洗注射器。
9.定期检查并清洗进样口衬管
仪器长期使用后，会发现衬管内积有焦油状物质，这是样品中不挥发成分造成的。此外还有颗粒状物质积存，这些都会干扰分析的正常进行。因此要定期检查，及时清洗。注意衬管中填充一些经硅烷化处理的石英玻璃毛，即可提高样品的汽化效率，又能防止隔垫碎屑进入色谱柱造成堵塞。
10.保留完整的仪器使用记录
这是仪器的履历，应逐日记录，包括操作者、分析样品及条件、仪器工作状态等等。一旦气相色谱仪出现问题，这是查找原因的重要资料。工厂企业往往有严格的操作程序，这方面要做得好一些。有一些实验室有时不太注意这个问题，实在不是一个好的习惯。
11. 更换零部件要逐一进行
修理仪器时，不要一次更换多个部件，那样会造成故障原因的判断失误。应该一次更换一件，经测试后再更换另一个。这样可能更准确地判断故障原因，同时避免不必要的开支。
