气相色谱柱可用于定量和定性分析，能测定样品在固定相上的分配系数、活度系数、分子量和比表面积等物理化学常数，可在石油、化工、生物化学、医药卫生、食品工业、环保等方面应用。
气相色谱柱的极性和非极性区别主要有固定相不同、分离顺序不同、柱温三种区别。
1、固定相种类不同：
气相色谱柱的极性取决于固定相的极性，非极性 主要使用100%Dimethyl polysiloxane，100%聚二甲基硅氧烷，商品名：AC1，OV-101，OV-1，DB-1，SE-30，HP-1，RTX-1，BP-1，极性柱主要使用polyethylene glycol,聚乙二醇为固定液，商品名：AC20，PEG20M，HP-INNOWAX(FFAP是其与2-硝基对苯二甲酸的反应产物)
2、分离顺序不同：
气相色谱柱非极性柱分离顺序主要是根据试液沸点，而气相色谱柱极性柱子分离顺序除了沸点之外还和物质的极性有关系。
3、柱温不同：
气相色谱柱极性柱子的使用温度比气相色谱柱非极性柱子的使用温度更低，这特性使得气相色谱柱非极性柱子更适合沸点高的物质分析。
