隔垫吹扫，又叫膈膜吹扫。主要是对气相色谱仪进样垫的吹扫气，隔垫吹扫就是在气相色谱仪进样口隔垫下有一股气流横向吹扫，这样做是为了把高温下隔垫的挥发物从隔垫吹扫出口放空，以避免色谱柱进入这些隔垫挥发物质，大大减少了隔垫流失物和隔垫上的吸附物所产生的干扰。
因为在毛细管分析中，对样品含量及杂质要求较严格。而进样垫又在进样口位置。一般温度都在150度以上。所以进样垫（普遍是橡胶类的，好的有一层聚四氟乙烯膜）会有有机物质等挥发出来。而回发出来的物质就会进入汽化室，进而污染气相色谱仪系统对分析结果会有较大影响。所以要把这些物质吹到色谱系统外面去。所以进样垫下面有一个吹扫气来将挥发物质吹走。这个就是隔垫吹扫气流。隔垫吹扫气流普遍为3~5ml/min就可以。
隔垫吹扫其作用主要有二个：a、消除进样时可能带入的杂质 b、消除进样口密封垫在高温时释放出的杂质。
